RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464263.1

RAB11FIP3-208, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RAB11FIP3, Length 329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IL20	Q9NYY1	176 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	POLQ	O75417	2590 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	XKRY	O14609	159 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IMPA2	O14732	288 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HS3ST1	O14792	307 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ARPC3	O15145	178 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TIPRL	O75663	272 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ATE1	O95260	518 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NR2C1	P13056	603 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MDP1	Q86V88	176 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NSMAF	Q92636	917 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HTRA1	Q92743	480 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NINJ1	Q92982	152 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FEV	Q99581	238 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NOX3	Q9HBY0	568 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	EDAR	Q9UNE0	448 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		H7C1C5	153 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SOCS2	O14508	198 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IDH3B	O43837	385 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MGRN1	O60291	552 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CIB2	O75838	187 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RAF1	P04049	648 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CD79A	P11912	226 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CD53	P19397	219 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GSTM3	P21266	225 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDA	P32320	146 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ARR3	P36575	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CAPZA2	P47755	286 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LCN6	P62502	163 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RAB1A	P62820	205 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PIGF	Q07326	219 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	COX10	Q12887	443 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ETFDH	Q16134	617 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GSG1	Q2KHT4	349 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BHLHE40	O14503	412 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ENTPD5	O75356	428 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	UBL3	O95164	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CELA3B	P08861	270 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CECR9	P0C854	216 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NPR2	P20594	1047 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PRKACG	P22612	351 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DNASE1	P24855	282 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NAAA	Q02083	359 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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