RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 MDS2Q8NDY4 140 aa8.3□□□□□ -1.08
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DDX39B-215ENST00000462256 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.29□□□□□ -1.08
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DDX39B-215ENST00000462256 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 NAXEQ8NCW5 288 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 LINC01560Q8TB33 94 aa8.29□□□□□ -1.08
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DDX39B-215ENST00000462256 RNF6Q9Y252 685 aa8.29□□□□□ -1.08
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DDX39B-215ENST00000462256 ARID1AO14497 2285 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TVP23AA6NH52 213 aa8.29□□□□□ -1.08
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DDX39B-215ENST00000462256 IFITM3Q01628 133 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 SKP2Q13309 424 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 BOD1Q96IK1 185 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.29□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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