RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 FAM86B1Q8N7N1 296 aa11.93□□□□□ -0.5
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PRAME-209ENST00000439106 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-209ENST00000439106 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-209ENST00000439106 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
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PRAME-209ENST00000439106 ERVK-25P63136 954 aa11.9□□□□□ -0.5
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PRAME-209ENST00000439106 GLYATQ6IB77 296 aa11.9□□□□□ -0.5
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PRAME-209ENST00000439106 HDDC2Q7Z4H3 204 aa11.9□□□□□ -0.5
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PRAME-209ENST00000439106 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-209ENST00000439106 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
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PRAME-209ENST00000439106 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-209ENST00000439106 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-209ENST00000439106 ENPP4Q9Y6X5 453 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-209ENST00000439106 COL6A5A8TX70 2615 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 LRP5LA4QPB2 252 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 A8MV72 311 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 VSTM5A8MXK1 200 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 CENPBD1B2RD01 187 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-209ENST00000439106 M0R233 179 aa11.89□□□□□ -0.51
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