RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	INIP	Q9NRY2	104 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		15.24	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MGRN1	O60291	552 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PIP5K1C	O60331	668 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TGFA	P01135	160 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ADRA2A	P08913	450 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TACSTD2	P09758	323 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FUT4	P22083	530 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MYBPC1	Q00872	1141 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GALK2	Q01415	458 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ST3GAL3	Q11203	375 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	RIN1	Q13671	783 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CARTPT	Q16568	116 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LRP11	Q86VZ4	500 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TPD52L3	Q96J77	140 aa		15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R233	179 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LILRA1	O75019	489 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	COX4I1	P13073	169 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF84	P51523	738 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LAPTM4A	Q15012	233 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC36A2	Q495M3	483 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SYT14	Q8NB59	555 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SYT3	Q9BQG1	590 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SOX7	Q9BT81	388 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TPK1	Q9H3S4	243 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MED4	Q9NPJ6	270 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		15.22	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FFAR1	O14842	300 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SNAP29	O95721	258 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LZIC	Q8WZA0	190 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NABP1	Q96AH0	204 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf198	Q9H425	327 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		15.21	■□□□□ 0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LRP5L	A4QPB2	252 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NME4	O00746	187 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TCF21	O43680	179 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC22	O60826	627 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS23	O95084	383 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A10	O95528	541 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHM	P01871	453 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IFI30	P13284	250 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL2	P13500	99 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LSP1	P33241	339 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC7A2	P52569	658 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC24C	P53992	1094 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LIPE	Q05469	1076 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FHL1	Q13642	323 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF11	Q15544	211 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CR1L	Q2VPA4	569 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG10	Q5BKT4	473 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CBLL1	Q75N03	491 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TREML1	Q86YW5	311 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF121	Q9H920	327 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SIAE	Q9HAT2	523 aa		15.2	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		J3KTA2	159 aa		15.19	■□□□□ 0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCR6	O00574	342 aa		15.19	■□□□□ 0.02

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