RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428313.5

C9orf3-206, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 2,288 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-206ENST00000428313 SULT1A2P50226 295 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 NHLH2Q02577 135 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CDK20Q8IZL9 346 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 COMMD1Q8N668 190 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF511Q8NB15 262 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PFN4Q8NHR9 129 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 F2RL3Q96RI0 385 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CD84Q9UIB8 345 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 COL4A3Q01955 1670 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CD1CP29017 333 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 LYPD6BQ8NI32 183 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 RSC1A1Q92681 617 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 GPR174Q9BXC1 333 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 LHX9Q9NQ69 397 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 DOK5Q9P104 306 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PLXNA2O75051 1894 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.074e-7■■■■□ 25.7
C9orf3-206ENST00000428313 HCKP08631 526 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 LYL1P12980 280 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PTNP21246 168 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CX3CR1P49238 355 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PRLHRP49683 370 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 NDUFA6P56556 154 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 OR5R1Q8NH85 324 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 RNF126Q9BV68 326 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 COCHO43405 550 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 MPZP25189 248 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 RABIFP47224 123 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 SLC7A9P82251 487 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CLINT1Q14677 625 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ACTBL2Q562R1 376 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 NRROSQ86YC3 692 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 WASF3Q9UPY6 502 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 VSIG4Q9Y279 399 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 KCNAB3O43448 404 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 FKTNO75072 461 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PCP4P48539 62 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF136P52737 540 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 EFNB2P52799 333 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PPP1R1AQ13522 171 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 FRMD1Q8N878 549 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 SEH1LQ96EE3 360 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 GALNT14Q96FL9 552 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 AQP10Q96PS8 301 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 STARD10Q9Y365 291 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 VWA8A3KMH1 1905 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 PCNTO95613 3336 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 M0QYG6 137 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 DAOP14920 347 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf3-206ENST00000428313 BIVMQ86UB2 503 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms