RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 CT45A2Q5DJT8 189 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 CT45A1Q5HYN5 189 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 LYSMD4Q5XG99 296 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FJX1Q86VR8 437 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00346Q8IVM7 164 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC16A11Q8NCK7 471 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 CT45A3Q8NHU0 189 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 HSD17B8Q92506 261 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FGGYQ96C11 551 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 Q96M85 177 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAM12O43184 909 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TIMP1P01033 207 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFA6P56556 154 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB11AP62491 216 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 COX20Q5RI15 118 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM64Q6YI46 380 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM71CQ8NEG0 241 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4A16Q8NH70 328 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SCARB1Q8WTV0 552 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC46A1Q96NT5 459 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PIGMQ9H3S5 423 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PISDQ9UG56 409 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FOLR1P15328 257 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS19P39019 145 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MED25Q71SY5 747 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RTL10Q7L3V2 364 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 GDF7Q7Z4P5 450 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC43A2Q8N370 569 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SUMF1Q8NBK3 374 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 LIPHQ8WWY8 451 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2FQ969M7 185 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NGBQ9NPG2 151 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2A25A4D2G3 310 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NXPH2O95156 264 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP11P24347 488 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NFYBP25208 207 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 GJA4P35212 333 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC6A11P48066 632 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 GABREP78334 506 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf76Q3KRA6 126 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM4DQ6B0I6 523 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RFLNAQ6ZTI6 216 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 LFNGQ8NES3 379 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FGF21Q9NSA1 209 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FITM1A5D6W6 292 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 STMND1H3BQB6 276 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SIGLEC6O43699 453 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SCRG1O75711 98 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35E2P0CK97 266 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SRMP19623 302 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.798e-9■■■■□ 23.1
EFTUD2-202ENST00000426333 ECI1P42126 302 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMB3P49720 205 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 HCCSP53701 268 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35A2P78381 396 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NR0B2Q15466 257 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS1R1Q7RTX1 841 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NAA40Q86UY6 237 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGPTL5Q86XS5 388 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 GCNT2Q8N0V5 402 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 HSFX1Q9UBD0 423 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM129A0AVI4 362 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ST8SIA3O43173 380 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 DDOSTP39656 456 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NPY4RP50391 375 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10K2Q6IF99 312 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC48A1Q6P1K1 146 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 VHLLQ6RSH7 139 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MAVSQ7Z434 540 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms