RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SKA3Q8IX90 412 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NSMAFQ92636 917 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEPHS2Q99611 448 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SH3GL3Q99963 347 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMURF2Q9HAU4 748 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CA10Q9NS85 328 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UNC119BA6NIH7 251 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR10H3O60404 316 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRT36O76013 467 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC2A10O95528 541 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHMP01871 453 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD14P08571 375 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 INHBBP09529 407 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FUT4P22083 530 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CALCRP30988 508 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RRM2P31350 389 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUDT6P53370 316 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERVK-25P63136 954 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DAG1Q14118 895 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SGCAQ16586 387 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C10orf128Q5T292 105 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BIVMQ86UB2 503 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRC18Q8N456 261 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUP37Q8NFH4 326 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR1J2Q8NGS2 313 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF570Q96NI8 536 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM15Q9C019 465 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C1orf21Q9H246 121 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C1orf198Q9H425 327 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEC61A2Q9H9S3 476 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SIAEQ9HAT2 523 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa10.78□□□□□ -0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SH3PXD2BA1X283 911 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 B9A039 149 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H7C1Q1 480 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDC42EP2O14613 210 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GYG2O15488 501 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SSX4O60224 188 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDE5AO76074 875 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SERPINA5P05154 406 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR4A8P0C604 315 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PATE4P0C8F1 98 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPS6KA3P51812 740 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HSF2Q03933 536 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB39AQ14964 217 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR139Q6DWJ6 353 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRT80Q6KB66 452 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DHRS1Q96LJ7 313 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNK17Q96T54 332 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THTPAQ9BU02 230 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF442Q9H7R0 627 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDH20Q9HBT6 801 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NOX3Q9HBY0 568 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CMAHPQ9Y471 501 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FKBP7Q9Y680 259 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACANP16112 2415 aa10.77□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A1W2PPL8 197 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC22A23A1A5C7 686 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM64BA6NI03 449 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H7C417 338 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AHCYL1O43865 530 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHV4-39P01824 125 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEMG1P04279 462 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 T-ENOLP0DO92 83 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NR4A1P22736 598 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDAP32320 146 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APLNRP35414 380 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THBS4P35443 961 aa10.76□□□□□ -0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OMPP47874 163 aa10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms