RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419249.2

AGRN-202, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 3

Gene AGRN, Length 861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-202ENST00000419249 ADCK1Q86TW2 530 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 CLDN22Q8N7P3 220 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 FANK1Q8TC84 345 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 ZNF570Q96NI8 536 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 UBTD1Q9HAC8 227 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 IL20Q9NYY1 176 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 FBXL3Q9UKT7 428 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 U3KQV3 271 aa15.98■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 PRSS37A4D1T9 235 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 ARHGEF9O43307 516 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 IDH3BO43837 385 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 SEC14L2O76054 403 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 UBL3O95164 117 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 GASTP01350 101 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 CD53P19397 219 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 NPR2P20594 1047 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 MYBPC1Q00872 1141 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 COX10Q12887 443 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 KEAP1Q14145 624 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 TESK1Q15569 626 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 MESTQ5EB52 335 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 SKA3Q8IX90 412 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 IGFBPL1Q8WX77 278 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 PIGTQ969N2 578 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 FBXW5Q969U6 566 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 SNX18Q96RF0 628 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 SIAEQ9HAT2 523 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.97■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 PLCE1Q9P212 2302 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 SLC22A23A1A5C7 686 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 GNGT2O14610 69 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 CIB2O75838 187 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 SLC2A10O95528 541 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 TUBA1BP68363 451 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 TUBA4AP68366 448 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 GSG1Q2KHT4 349 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 TUBA1AQ71U36 451 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 MDP1Q86V88 176 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 GIPC3Q8TF64 312 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 ZNF75AQ96N20 296 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 FOXC2Q99958 501 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
AGRN-202ENST00000419249 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 HLA-HP01893 362 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 CECR9P0C854 216 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 CAPZA2P47755 286 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 CDH11P55287 796 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 NAAAQ02083 359 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 FMODQ06828 376 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 SLC22A25Q6T423 547 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 NABP1Q96AH0 204 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 NRBF2Q96F24 287 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 SAMD8Q96LT4 415 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.95■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 CRYAAP02489 173 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 DANCRP0C864 163 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 CD79AP11912 226 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 ART1P52961 327 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 RAB1AP62820 205 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 SLC36A2Q495M3 483 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 FAM27BQ5VT28 67 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 NSMAFQ92636 917 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 NEUROG1Q92886 237 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 RASD2Q96D21 266 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 FEVQ99581 238 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.94■□□□□ 0.14
AGRN-202ENST00000419249 KCNS3Q9BQ31 491 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms