RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB6AP20340 208 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM215Q68D42 235 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 VHLLQ6RSH7 139 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF254O75437 659 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OPCMLQ14982 345 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 LTC4SQ16873 150 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CORO6Q6QEF8 472 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNE3Q9Y6H6 103 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 EDN3P14138 238 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CYB561P49447 251 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CCR5P51681 352 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZS52 159 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SLAMF9Q96A28 289 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PNR3 127 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 UBBP0CG47 229 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CCR9P51686 369 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA0040Q15053 153 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 AGERQ15109 404 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF681Q96N22 645 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC38A1Q9H2H9 487 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ETV7Q9Y603 341 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 B8ZZF3 427 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 DIO1P49895 249 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP2K6P52564 334 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MSRB3Q8IXL7 192 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX19Q8NA77 164 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SDSLQ96GA7 329 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 EMC7Q9NPA0 242 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GABRA2P47869 451 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FCRL6Q6DN72 434 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ICOSLGO75144 302 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SIX6O95475 246 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TGM4P49221 684 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF136P52737 540 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CALHM3Q86XJ0 350 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 LACC1Q8IV20 430 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GJC3Q8NFK1 279 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 STK35Q8TDR2 534 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OLFM2O95897 454 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SRFP11831 508 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MYF5P13349 255 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CPT2P23786 658 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SOX18P35713 384 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 HTR4Q13639 388 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00299Q6ZSB3 139 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OPALINQ96PE5 141 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CPEP16870 476 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CD53P19397 219 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OMGP23515 440 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SDHAP31040 664 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 HSF1Q00613 529 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TEKQ02763 1124 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A087WV62 115 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR171O14626 319 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FADS1O60427 444 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 FABP5Q01469 135 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5H6Q8NGV6 325 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 AQP6Q13520 282 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 MUCL1Q96DR8 90 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 BANF2Q9H503 90 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 PMPCAQ10713 525 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 BCL2A1Q16548 175 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ASH2LQ9UBL3 628 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0B4J2A0 478 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ACTBL2Q562R1 376 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-202ENST00000392011 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms