RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 COPEO14579 308 aa4.5□□□□□ -1.69
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RNU6-171P-201ENST00000384354 UBL3O95164 117 aa4.5□□□□□ -1.69
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC2A10O95528 541 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNAP29O95721 258 aa4.5□□□□□ -1.69
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.49□□□□□ -1.69
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