RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373920.6

PSMD5-204, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 5, human

TSL 5

Gene PSMD5, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD5-204	ENST00000373920	CECR9	P0C854	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	B4GALT1	P15291	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	FUT1	P19526	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	HOXA5	P20719	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CALCR	P30988	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	KDELR2	P33947	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SERPINF1	P36955	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	NUDT2	P50583	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC7A2	P52569	658 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	GYS2	P54840	703 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	NAAA	Q02083	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	LIPE	Q05469	1076 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	MELK	Q14680	651 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ETFDH	Q16134	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63	4e-9	■■■■■ 34.1
PSMD5-204	ENST00000373920	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920		A0A1W2PRG6	482 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920		J3KTA2	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CXCR6	O00574	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SLC22A2	O15244	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	OR7A10	O76100	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	OR5F1	O95221	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	RAB36	O95755	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	MT-ND1	P03886	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	HEXA	P06865	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	QDPR	P09417	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	OR4A8	P0C604	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	IFI30	P13284	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CBR1	P16152	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	NCK1	P16333	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	IFNA8	P32881	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	THBS4	P35443	961 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	ARR3	P36575	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	AQP2	P41181	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	UGT2B15	P54855	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	CLRN1	P58418	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	RAB1A	P62820	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	SELENOW	P63302	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMD5-204	ENST00000373920	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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