RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PFN4Q8NHR9 129 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 SGTBQ96EQ0 304 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 FOXB1Q99853 325 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 REG4Q9BYZ8 158 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NOX3Q9HBY0 568 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 COL6A5A8TX70 2615 aa6.65□□□□□ -1.34
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA1O95477 2261 aa6.65□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRG6 482 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS12A0PJE2 317 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 INAFM1C9JVW0 142 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MCIDASD6RGH6 385 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GSC2O15499 205 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PIP5K1CO60331 668 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PDE5AO76074 875 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR7A10O76100 309 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IGHG1P01857 330 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR4A8P0C604 315 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PGA4P0DJD7 388 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PGA3P0DJD8 388 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RAP2AP10114 183 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CD79AP11912 226 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINF1P36955 418 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEA2P43356 314 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 EFNA4P52798 201 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DSCR9P59020 149 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ADIPOQQ15848 244 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GSG1Q2KHT4 349 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MST1LQ2TV78 715 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FGD3Q5JSP0 725 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LIPHQ8WWY8 451 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM54Q969K7 222 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF566Q969W8 418 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf34Q96L11 122 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GLTPQ9NZD2 209 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FKBP7Q9Y680 259 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CENPBD1B2RD01 187 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 B9A039 149 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LY6HO94772 140 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 UBL3O95164 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GADD45GO95257 159 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RAB36O95755 333 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 BCL10O95999 233 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SEMG1P04279 462 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 F13BP05160 661 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CSF3P09919 207 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FCGR1AP12314 374 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FUT1P19526 365 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NPR2P20594 1047 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1B2P21281 511 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RRM2P31350 389 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 THBS4P35443 961 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 AQP2P41181 271 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GIPRP48546 466 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PPOXP50336 477 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CLRN1P58418 232 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PPP2R2BQ00005 443 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SPIBQ01892 262 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 HGFACQ04756 655 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PIGFQ07326 219 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DAG1Q14118 895 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 EFNB3Q15768 340 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 KRT80Q6KB66 452 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA24Q86W54 205 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FNDC8Q8TC99 324 aa6.63□□□□□ -1.35
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