RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 TMEM27Q9HBJ8 222 aa15.27■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MMP26Q9NRE1 261 aa15.27■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GVT2 93 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 M0QYG6 137 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SLC31A1O15431 190 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 GDI1P31150 447 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SLC6A6P31641 620 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CENPAP49450 140 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RAB28P51157 221 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 EIPR1Q53HC9 387 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 LPCAT3Q6P1A2 487 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 BIVMQ86UB2 503 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TMEM100Q9NV29 134 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RDH16O75452 317 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NPIPA8P0DM63 369 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 LAMP2P13473 410 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PRSS3P35030 304 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 HSD17B2P37059 387 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PRKXP51817 358 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CXADRP78310 365 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SGCGQ13326 291 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 GAS6Q14393 721 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PON3Q15166 354 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RNF212Q495C1 297 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 Q499Y3 187 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR51D1Q8NGF3 324 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 STOML3Q8TAV4 291 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RNF141Q8WVD5 230 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 Q96M85 177 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CLCC1Q96S66 551 aa15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PQU0 124 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CLN5O75503 358 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PBX2P40425 430 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 AKR1C3P42330 323 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 GGTLC2Q14390 218 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 C9orf152Q5JTZ5 239 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MFSD12Q6NUT3 480 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PARGQ86W56 976 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 GALNT16Q8N428 558 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RPS4Y2Q8TD47 263 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H2BAQ96A08 127 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 MYADMQ96S97 322 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RAB3DO95716 219 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CEACAM5P06731 702 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CERS1P27544 350 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 KCNAB1Q14722 419 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CES1P1Q9UKY3 287 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.25■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CLEC3AO75596 197 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 WNT11O96014 354 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CD74P04233 296 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 AMY2AP04746 511 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 APODP05090 189 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 PGAM2P15259 253 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 F2RL1P55085 397 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SSTP61278 116 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 OR7G2Q8NG99 324 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 GDE1Q9NZC3 331 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 SPTBP11277 2137 aa15.24■□□□□ 0.03
GDE1-201ENST00000353258 LRRC72A6NJI9 287 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms