RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SYT4Q9H2B2 425 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS50Q9UI38 385 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 BPTFQ12830 3046 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JNJ9 132 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ASPDHA6ND91 283 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TOR1AO14656 332 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 GPANK1O95872 356 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TGM6O95932 706 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 OR4A8P0C604 315 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A8P0DMV1 189 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A9P0DMV2 189 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SRD5A1P18405 259 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TALDO1P37837 337 aa3.96□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF81P51508 661 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SELPLGQ14242 412 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TAB1Q15750 504 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A2Q5DJT8 189 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 FAM57BQ71RH2 274 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 OR8J3Q8NGG0 315 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 NRGNQ92686 78 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 CHID1Q9BWS9 393 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 AMBNQ9NP70 447 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 Q9UFV3 132 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 AGAP5A6NIR3 686 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 UBL3O95164 117 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1G2O95670 118 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 MT-ATP6P00846 226 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 GUSBP08236 651 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA8P13928 327 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 SOX2P48431 317 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 NKAPLQ5M9Q1 402 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 GPR157Q5UAW9 335 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 GJC3Q8NFK1 279 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PSMF1Q92530 271 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ASB9Q96DX5 294 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 J3QLW9 94 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PDLIM1O00151 329 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP6O75344 327 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 NXPH2O95156 264 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PSMG1O95456 288 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 GYPBP06028 91 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ARAFP10398 606 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF19P17023 458 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 MSR1P21757 451 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ADH6P28332 368 aa3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 NRF1Q16656 503 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ZBED5Q49AG3 693 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC36Q8IYA8 594 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PYURFQ96I23 114 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 RNF170Q96K19 258 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 FCRL1Q96LA6 429 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 Q96M85 177 aa3.95□□□□□ -1.78
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