RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 GAAP10253 952 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PNMTP11086 282 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PTHLHP12272 177 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 AWAT2Q6E213 333 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PMM1Q92871 262 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 Q96M85 177 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TLCD2A6NGC4 264 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RAG2P55895 527 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RAB38P57729 211 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 HSD11B2P80365 405 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 NR0B2Q15466 257 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 AVPI1Q5T686 147 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM225Q6GV28 225 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SYT13Q7L8C5 426 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR7G2Q8NG99 324 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR4D11Q8NGI4 311 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 STK35Q8TDR2 534 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 NAT6Q93015 286 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CACNA1HO95180 2353 aa15.64■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM212A6NML5 194 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 H7C417 338 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF28P17035 718 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SMRP1Q8NCR6 262 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 NAXEQ8NCW5 288 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR6C1Q96RD1 312 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SULT1C2O00338 296 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 AMER3Q8N944 861 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM234Q8WY98 164 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CLEC1BQ9P126 229 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 H3BML4 177 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LANCL1O43813 399 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SLC16A7O60669 478 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 UBL4AP11441 157 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PGCP20142 388 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RNLSQ5VYX0 342 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 YIPF5Q969M3 257 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CDC6Q99741 560 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GLULP15104 373 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GALP22466 123 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CCR5P51681 352 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ESX1Q8N693 406 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF283Q8N7M2 679 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 FGF17O60258 216 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SCRG1O75711 98 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TAS2R31P59538 309 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PLGLB1Q02325 96 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SYS1Q8N2H4 156 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TP53I11O14683 189 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SEMG1P04279 462 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CALCBP10092 127 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CDH26Q8IXH8 852 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR5L2Q8NGL0 311 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 C2CD4CQ8TF44 421 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RNF141Q8WVD5 230 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00052Q96N35 136 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 C12orf10Q9HB07 376 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SHOXO15266 292 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SYT7O43581 403 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CASRP41180 1078 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 ZFP82Q8N141 532 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 C17orf47Q8NEP4 570 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 C12orf57Q99622 126 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 POFUT1Q9H488 388 aa15.62■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 CACNA1GO43497 2377 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 METTL12A8MUP2 240 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 E9PI62 339 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.61■□□□□ 0.09
TRPC1-201ENST00000273482 HTR2CP28335 458 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms