RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MIDNQ504T8 468 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 KLHL26Q53HC5 615 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 IGSF11Q5DX21 431 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CBLN3Q6UW01 205 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TMEM107Q6UX40 140 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.21□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 OR8H3Q8N146 312 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 GJC3Q8NFK1 279 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OR52N5Q8NH56 324 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.21□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 RITA1Q96K30 269 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ACPTQ9BZG2 426 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 EMC3Q9P0I2 261 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CMAHPQ9Y471 501 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.21□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 M0R1B8 84 aa6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 GPR171O14626 319 aa6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 ACP2P11117 423 aa6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 ADRA2CP18825 462 aa6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 ASMTP46597 345 aa6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 GUCY2DQ02846 1103 aa6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 TRIP10Q15642 601 aa6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.2□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 SERPINA11Q86U17 422 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ST8SIA1Q92185 356 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PIK3R3Q92569 461 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 APH1AQ96BI3 265 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 LRRC58Q96CX6 371 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FBXO17Q96EF6 278 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 HARBI1Q96MB7 349 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 DECR2Q9NUI1 292 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.2□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CLDN34H7C241 214 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MANBAO00462 879 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PMS2P2O95744 297 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PNPP00491 289 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 IGKV3-15P01624 115 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 RBP1P09455 135 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 NPIPA8P0DM63 369 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TFPIP10646 304 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PRPS2P11908 318 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ETFAP13804 333 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CPT2P23786 658 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 EVX1P49640 407 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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