RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608369.1

LINC00963-211, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00963, Length 961 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-211ENST00000608369 ARPC3O15145 178 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 SURF4O15260 269 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 OR2T1O43869 369 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 OR7A10O76100 309 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 FADS2O95864 444 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 HTR1AP08908 422 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF3P17036 446 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PCMT1P22061 227 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 DPP4P27487 766 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CCR4P51679 360 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF117Q03924 483 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 POU4F2Q12837 409 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 NEDD8Q15843 81 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 SYT14P1Q58G82 188 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 WDR88Q6ZMY6 472 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PRR22Q8IZ63 422 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF611Q8N823 705 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TCEANCQ8N8B7 351 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 STK35Q8TDR2 534 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 LRR1Q96L50 414 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 IL4I1Q96RQ9 567 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TSC22D3Q99576 134 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 GPA33Q99795 319 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 JAM3Q9BX67 310 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 FKRPQ9H9S5 495 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ACOT13Q9NPJ3 140 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CMC2Q9NRP2 79 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 INPP5EQ9NRR6 644 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TVP23BQ9NYZ1 205 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF229Q9UJW7 825 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PROCRQ9UNN8 238 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CARD8Q9Y2G2 431 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.05□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 A0A087WZY1 265 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 SLC22A31A6NKX4 558 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 BHLHE40O14503 412 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CDC42EP2O14613 210 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 SIAH2O43255 324 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 RAB36O95755 333 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TGM6O95932 706 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 MT-ND2P03891 347 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 DBTP11182 482 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 MYL12AP19105 171 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 FUT4P22083 530 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CXCR1P25024 350 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF91Q05481 1191 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ST3GAL4Q11206 333 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PMS2P3Q13401 168 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CNPY1Q3B7I2 92 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 FOXB2Q5VYV0 432 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 FAM214BQ7L5A3 538 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 EGFL6Q8IUX8 553 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PFN4Q8NHR9 129 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TMEM158Q8WZ71 300 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 GGHQ92820 318 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TMEM80Q96HE8 168 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PIGQQ9BRB3 760 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PRR14Q9BWN1 585 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 MND1Q9BWT6 205 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 EGLN3Q9H6Z9 239 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 GLRX2Q9NS18 164 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ERVK-18Q9QC07 812 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 HIF3AQ9Y2N7 669 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 EMC9Q9Y3B6 208 aa10.04□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 A8MVM7 634 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 SLC22A1O15245 554 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF208O43345 1280 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PRKYO43930 277 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PIP5K1CO60331 668 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ZIC3O60481 467 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 ENTPD6O75354 484 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 PTP4A3O75365 173 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00963-211ENST00000608369 CGAP01215 116 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms