RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 CRISP1P54107 249 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GUSBP1Q15486 140 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD34AQ69YU3 496 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 THSD4Q6ZMP0 1018 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SEM1Q6ZVN7 128 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM158Q8WZ71 300 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGTQ969N2 578 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PPR1 153 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 CENPBD1B2RD01 187 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 MCIDASD6RGH6 385 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 BCL10O95999 233 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 F13BP05160 661 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SORDQ00796 357 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 NPRL3Q12980 569 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SNCBQ16143 134 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM214BQ7L5A3 538 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM8Q8N371 416 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 KATNB1Q9BVA0 655 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 IFT27Q9BW83 186 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 A6NIZ1 184 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6C65A6NJZ3 312 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TXNDC12O95881 172 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 IL18BPO95998 194 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 AGTR1P30556 359 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SDHAP31040 664 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 RAP1BP61224 184 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL27P61353 136 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 RAP1AP62834 184 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ACKR1Q16570 336 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 LNX2Q8N448 690 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 NAXEQ8NCW5 288 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6K3Q8NGY3 331 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6X1Q8NH79 312 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 NRG4Q8WWG1 115 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 SFXN3Q9BWM7 321 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 BHLHE40O14503 412 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 NR2C1P13056 603 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 HLA-DOBP13765 273 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 IFNGR1P15260 489 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 POU1F1P28069 291 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GRK5P34947 590 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 VHLP40337 213 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 GIPRP48546 466 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 PGGHGQ32M88 737 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM122BQ7Z309 247 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 TUSC5Q8IXB3 177 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF726A6NNF4 738 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ZAR1LA6NP61 321 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 AHCYL1O43865 530 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINI2O75830 405 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R3DO95685 299 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 HMGN1P05114 100 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CTSSP25774 331 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDN17P56750 224 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK5Q00535 292 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 GINS1Q14691 196 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 AAED1Q7RTV5 226 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ADCK1Q86TW2 530 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 FNDC8Q8TC99 324 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ASB10Q8WXI3 467 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF570Q96NI8 536 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX18Q96RF0 628 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 TOR3AQ9H497 397 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 F12P00748 615 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 NOS3P29474 1203 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 OPRM1P35372 400 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVK-25P63136 954 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF519Q8TB69 540 aa20.81■□□□□ 0.92
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