RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF607Q96SK3 696 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC52A3Q9NQ40 469 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R5Q9NYW4 299 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 GMEB1Q9Y692 573 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A23A1A5C7 686 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM77I1YAP6 450 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPP2O43688 288 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MFN2O95140 757 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MPZL1O95297 269 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF250P15622 560 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIBP23284 216 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A2P23975 617 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 RBBP4Q09028 425 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CROCCP2Q86T23 111 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SMYD1Q8NB12 490 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNPRQ8TBG9 265 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF566Q969W8 418 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDL1Q96EA4 605 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MCHR1Q99705 422 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB7O75635 380 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6A2O95222 327 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ANPEPP15144 967 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 GPX2P18283 190 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC18A1P54219 525 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF74Q16587 644 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4K5Q8NGD3 323 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH20Q9HBT6 801 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF7L2Q9NQB0 619 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR160Q9UJ42 338 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNG2Q9Y698 323 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 DHHO43323 396 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CHP2O43745 196 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CH25HO95992 272 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 THY1P04216 161 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 LCKP06239 509 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PGA4P0DJD7 388 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PGA3P0DJD8 388 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRA2CP18825 462 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYBB2P43320 205 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOVP59797 346 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZP4Q12836 540 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 NPTX1Q15818 432 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PCGF3Q3KNV8 242 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF613Q6PF04 617 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QL2Q7Z5L3 287 aa21.85■■□□□ 1.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 HIPK4Q8NE63 616 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SGMS2Q8NHU3 365 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF519Q8TB69 540 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX33Q8WV41 574 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGDIGQ99819 225 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 EVA1AQ9H8M9 152 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF121Q9H920 327 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.85■■□□□ 1.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0X1KG70 313 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF13O43567 381 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 FMO6PO60774 539 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 LYPD3O95274 346 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 FARS2O95363 451 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 MMEL1Q495T6 779 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM53Q6P2H8 277 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR32P1Q8NGA4 272 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4M2Q8NGB6 313 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf40Q8WZ69 217 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB39BQ96DA2 213 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A7Q99884 636 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 WIPI2Q9Y4P8 454 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV2-5P01817 119 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 OPN1SWP03999 348 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 QDPRP09417 244 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 UCP2P55851 309 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 GLO1Q04760 184 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP7Q16829 419 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D28Q2M2D7 210 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ENTPD8Q5MY95 495 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 USP51Q70EK9 711 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ICA1LQ8NDH6 482 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6T1Q8NGN1 323 aa21.83■■□□□ 1.09
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