RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 NMNAT3Q96T66 252 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 APOL4Q9BPW4 351 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 GLTPQ9NZD2 209 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 JKAMPQ9P055 326 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 MALT1Q9UDY8 824 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PROCRQ9UNN8 238 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 RNF6Q9Y252 685 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 FLNCQ14315 2725 aa10.17□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 OR6C68A6NDL8 312 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 DVL2O14641 736 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 MSTNO14793 375 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PRKYO43930 277 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 UPK3AO75631 287 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 RENP00797 406 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 GABRB1P18505 474 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 AGAP20933 346 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PAICSP22234 425 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 EDNRAP25101 427 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CRABP1P29762 137 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A1P53007 311 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ISL1P61371 349 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SIRPAP78324 504 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CRMP1Q14194 572 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 FBXW9Q5XUX1 488 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 LEG1Q6P5S2 330 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 LRFN4Q6PJG9 635 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZT83 130 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 MRGPRGQ86SM5 289 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ZBTB46Q86UZ6 589 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 GPR137CQ8N3F9 429 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 TCEANCQ8N8B7 351 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SYT14Q8NB59 555 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SETD9Q8NE22 299 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SDR9C7Q8NEX9 313 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 OR6N1Q8NGY5 312 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 RHOXF1Q8NHV9 184 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 FAM81AQ8TBF8 368 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ASB5Q8WWX0 329 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PTP4A1Q93096 173 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 MCHR2Q969V1 340 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CCDC120Q96HB5 630 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 MUS81Q96NY9 551 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ANKRD60Q9BZ19 345 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SYT4Q9H2B2 425 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SLC7A10Q9NS82 523 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 IMPAD1Q9NX62 359 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ZNF226Q9NYT6 803 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SLC5A6Q9Y289 635 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 FKBP7Q9Y680 259 aa10.16□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 A8MXE2 369 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 M0R3G1 203 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PRODHO43272 600 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 QDPRP09417 244 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 GNAO1P09471 354 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CHRNB4P30926 498 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CENPAP49450 140 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 TEKQ02763 1124 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CD47Q08722 323 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 OCLNQ16625 522 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 C6orf52Q5T4I8 152 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 AADACL4Q5VUY2 407 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 NXNL2Q5VZ03 156 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CARD17Q5XLA6 110 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 DNM1P34Q6PK57 102 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 BEND4Q6ZU67 534 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ZNF627Q7L945 461 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 LINGO2Q7L985 606 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 LIX1LQ8IVB5 337 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CPOQ8IVL8 374 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ENTHD1Q8IYW4 607 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 OR6V1Q8N148 313 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 CYB561A3Q8NBI2 242 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 OR2T4Q8NH00 348 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 BOD1Q96IK1 185 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ULBP2Q9BZM5 246 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 NUAK2Q9H093 628 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 C12orf49Q9H741 205 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 GPR35Q9HC97 309 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 ASB6Q9NWX5 421 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 UPB1Q9UBR1 384 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 PRSS50Q9UI38 385 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 MOKQ9UQ07 419 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 GPR52Q9Y2T5 361 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-211ENST00000582232 LRRC42Q9Y546 428 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms