RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563207.1

USB1-208, Transcript of U6 snRNA biogenesis phosphodiesterase 1, human

TSL 5

Gene USB1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USB1-208	ENST00000563207	IFNGR1	P15260	489 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	PAX1	P15863	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	GSTM3	P21266	225 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ATP5J2	P56134	94 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	TNK1	Q13470	666 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	FHL1	Q13642	323 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	STK11	Q15831	433 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ASB6	Q9NWX5	421 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	INAFM1	C9JVW0	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	GAST	P01350	101 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CD3E	P07766	207 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ANXA8	P13928	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SELENOP	P49908	381 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CTXN1	P60606	82 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	FAP	Q12884	760 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	PGGHG	Q32M88	737 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	HSD17B8	Q92506	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	GPA33	Q99795	319 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CR1	P17927	2039 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CAD	P27708	2225 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	OVOL3	O00110	214 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SERPINI2	O75830	405 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	KRT33A	O76009	404 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CD8A	P01732	235 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	F13B	P05160	661 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CD14	P08571	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	NR2C1	P13056	603 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	COX5A	P20674	150 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	MPG	P29372	298 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	BID	P55957	195 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	RFX4	Q33E94	735 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SVOPL	Q8N434	492 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ZNF566	Q969W8	418 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	FEV	Q99581	238 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	MED29	Q9NX70	200 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	IL20	Q9NYY1	176 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USB1-208	ENST00000563207	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.71	□□□□□ -0.22
USB1-208	ENST00000563207		A6NIZ1	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-208	ENST00000563207	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-208	ENST00000563207	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USB1-208	ENST00000563207	PDLIM1	O00151	329 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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