RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 PPICP45877 212 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 BLKP51451 505 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CCR5P51681 352 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RAG2P55895 527 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PUDPQ08623 228 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 C2orf68Q2NKX9 166 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 C1orf189Q5VU69 101 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 UXS1Q8NBZ7 420 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ACTR6Q9GZN1 396 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PDE7BQ9NP56 450 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 A0A1B0GVI7 797 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 DDAH2O95865 285 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CXCR1P25024 350 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MELKQ14680 651 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GRK1Q15835 563 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CSRP2Q16527 193 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SIX5Q8N196 739 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NPAS1Q99742 590 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MOKQ9UQ07 419 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RGS11O94810 467 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MPZL1O95297 269 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RENP00797 406 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ITGA5P08648 1049 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF721Q8TF20 911 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 KLHL15Q96M94 604 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CUTCQ9NTM9 273 aa16.01■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 FER1L5A0AVI2 2057 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SPARCP09486 303 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 VSIG10L2P0DP72 767 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CALCBP10092 127 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 IL11P20809 199 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SERTAD2Q14140 314 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MEIOBQ8N635 442 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR8S1Q8NH09 359 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CCDC120Q96HB5 630 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF285Q96NJ3 590 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NPTNQ9Y639 398 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 VPS13AQ96RL7 3174 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 BGLAPP02818 100 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RORAP35398 523 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 FASLGP48023 281 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ACKR1Q16570 336 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR7E24Q6IFN5 339 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CCDC28AQ8IWP9 274 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 LIPHQ8WWY8 451 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 C4orf45Q96LM5 186 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CMTM3Q96MX0 182 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ADAM19Q9H013 955 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 COMMD4Q9H0A8 199 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 NARFLQ9H6Q4 476 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GLTPQ9NZD2 209 aa16■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 A0A1B0GUH1 482 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 I3L521 148 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ACOT7O00154 380 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 SLC16A7O60669 478 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TXNDC12O95881 172 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 TGM6O95932 706 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CXCL2P19875 107 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 IL12BP29460 328 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 COL28A1Q2UY09 1125 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 GPR139Q6DWJ6 353 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms