RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 THY1P04216 161 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 QDPRP09417 244 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 GLRXP35754 106 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 GUCY1A3Q02108 690 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MELKQ14680 651 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 DOK1Q99704 481 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 CDH20Q9HBT6 801 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.63□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SYNGR3O43761 229 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SERPINA5P05154 406 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 DAOP14920 347 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 HNF1AP20823 631 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 OR1E2P47887 323 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SELENOWP63302 87 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 NRN1LQ496H8 165 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 CDK20Q8IZL9 346 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 RCN3Q96D15 328 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 TMEM160Q9NX00 188 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.62□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ATRQ13535 2644 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 M0R233 179 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 IFNW1P05000 195 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 F13BP05160 661 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ADRA2AP08913 450 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 PGA4P0DJD7 388 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 PGA3P0DJD8 388 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 TNFRSF1BP20333 461 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 RAB39AQ14964 217 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 TAF11Q15544 211 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 FAM166AQ6J272 317 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 RRM2BQ7LG56 351 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SKA3Q8IX90 412 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 PFN4Q8NHR9 129 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 PRRC1Q96M27 445 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ARMCX1Q9P291 453 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.61□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 A0A096LNT2 108 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 LMX1BO60663 402 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 GMNNO75496 209 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ZNF35P13682 527 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ACADSP16219 412 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 AQP2P41181 271 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 CRYBA2P53672 197 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 UGT2B15P54855 530 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 HSF2Q03933 536 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MOGQ16653 247 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SYT14Q8NB59 555 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 FNDC8Q8TC99 324 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MCHR2Q969V1 340 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 RBP7Q96R05 134 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SH3GL3Q99963 347 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 DUSP13Q9UII6 198 aa14.6□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 A0A1W2PPW3 197 aa14.59□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 VWC2LB2RUY7 222 aa14.59□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 STAMBPO95630 424 aa14.59□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 ZNF682O95780 498 aa14.59□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 MT-ND5P03915 603 aa14.59□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 FAM157CP0CG43 387 aa14.59□□□□□ -0.07
CASP9-211ENST00000546969 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms