RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CARD17Q5XLA6 110 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 MUC15Q8N387 334 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TMEM239Q8WW34 195 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TXNDC15Q96J42 360 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 VCXQ9H320 206 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.52□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ROS1P08922 2347 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 A0A1W2PRQ8 180 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 C11orf98E9PRG8 122 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 H7C1Q1 480 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 RNF13O43567 381 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 E2F6O75461 281 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IGKV3-15P01624 115 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IGLV1-44P01699 117 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CRYAAP02489 173 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 BMP4P12644 408 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IFNGR1P15260 489 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 DGCR6Q14129 220 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ZNF627Q7L945 461 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 OR6X1Q8NH79 312 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 PKP2Q99959 881 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 MOKQ9UQ07 419 aa14.51□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TRIM64BA6NI03 449 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 OR7A10O76100 309 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 GADD45GO95257 159 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CBR1P16152 277 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ARR3P36575 388 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CSNK1A1P48729 337 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 UGT2B15P54855 530 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 BIDP55957 195 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SPIBQ01892 262 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CAMK2DQ13557 499 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TRAM2Q15035 370 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 LIPHQ8WWY8 451 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SGTBQ96EQ0 304 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 MED31Q9Y3C7 131 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.5□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 DSCAMO60469 2012 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TNFRSF11BO00300 401 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IGHV4-39P01824 125 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CECR9P0C854 216 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 RRM2P31350 389 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IFNGR2P38484 337 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TUBA1BP68363 451 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TUBA4AP68366 448 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NAAAQ02083 359 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TRIP10Q15642 601 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TUBA1AQ71U36 451 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 PFN4Q8NHR9 129 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TMEM54Q969K7 222 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ZNF566Q969W8 418 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 EME1Q96AY2 570 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms