RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	F5	P12259	2224 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MLNR	O43193	412 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MYO1D	O94832	1006 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	GLCE	O94923	617 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	STAMBP	O95630	424 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LAMP1	P11279	417 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	UQCRB	P14927	111 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	GABRG2	P18507	467 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IL1RN	P18510	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IL10	P22301	178 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CXCR2	P25025	360 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SHC1	P29353	583 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ASMT	P46597	345 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RGS19	P49795	217 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CCR8	P51685	355 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SRPX	P78539	464 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PDE7A	Q13946	482 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SELPLG	Q14242	412 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF146	Q15072	292 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LPAL2	Q16609	132 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SPIN4	Q56A73	249 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	STARD8	Q92502	1023 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	NRTN	Q99748	197 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RMND5A	Q9H871	391 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908		A0A087X0K7	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908		A4D1N5	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RFXANK	O14593	260 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ACOX3	O15254	700 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TBX19	O60806	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CRLF1	O75462	422 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SEMA3D	O95025	777 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SCEL	O95171	688 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LRAT	O95237	230 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C1QC	P02747	245 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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