RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC45Q96CN5 670 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PIK3IP1Q96FE7 263 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 FOPNLQ96NB1 174 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TSSK1BQ9BXA7 367 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DRC3Q9H069 523 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF665Q9H7R5 613 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SRD5A3Q9H8P0 318 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ANKHQ9HCJ1 492 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 HYOU1Q9Y4L1 999 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 FAM215AQ9Y5M1 114 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SNX5Q9Y5X3 404 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MACROD2A1Z1Q3 448 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC162PA2VCL2 907 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TXNDC9O14530 226 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 BCKDKO14874 412 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 HAT1O14929 419 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ANXA9O76027 345 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC16A8O95907 504 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 EPOP01588 193 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 FHP07954 510 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ATP6V1B1P15313 513 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MSNP26038 577 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CCR7P32248 378 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PEX19P40855 299 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC1A3P43003 542 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MAGEA5P43359 124 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MAGEB1P43366 347 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DNASE1L1P49184 302 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SSR4P51571 173 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP12-2P59991 146 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 UBE2HP62256 183 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DMTNQ08495 405 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PTK6Q13882 451 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TFDP2Q14188 446 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ITIH4Q14624 930 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 POU6F1Q14863 301 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC10A1Q14973 349 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ABRAXAS2Q15018 415 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM44Q2T9K0 475 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 IQCCQ4KMZ1 466 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 NHLRC3Q5JS37 347 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF506Q5JVG8 444 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 AGAP6Q5VW22 663 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RNLSQ5VYX0 342 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 C11orf88Q6PI97 169 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PET117Q6UWS5 81 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 MFSD7Q6UXD7 560 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PRSS41Q7RTY9 318 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC22A16Q86VW1 577 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PIANPQ8IYJ0 282 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OTUD6BQ8N6M0 293 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR2M7Q8NG81 312 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR5T3Q8NGG3 340 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 OR2A1Q8NGT9 310 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ASZ1Q8WWH4 475 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 P3H4Q92791 437 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 FAF2Q96CS3 445 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF285Q96NJ3 590 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CCL19Q99731 98 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TBL1YQ9BQ87 522 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC77Q9BR77 488 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ANP32EQ9BTT0 268 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TTTY12Q9BZ98 90 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 HPF1Q9NWY4 346 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 B4GALT7Q9UBV7 327 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 TAC3Q9UHF0 121 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SH3GLB1Q9Y371 365 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 ETV7Q9Y603 341 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SCN2AQ99250 2005 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-209ENST00000522928 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms