RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 NDUFB10O96000 172 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGKV2D-28P01615 120 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC2A3P11169 496 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 KITLGP21583 273 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 ASB3Q9Y575 518 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 GOSR2O14653 212 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 AK4P27144 223 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 TPMTP51580 245 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SSX2Q16385 188 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 LCE3AQ5TA76 89 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZFP90Q8TF47 636 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SHC3Q92529 594 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM54Q969K7 222 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 BMFQ96LC9 184 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 H0Y8G0 127 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 C6orf47O95873 294 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 CASP14P31944 242 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SERPINB5P36952 375 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SULT1E1P49888 294 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC00315P59091 139 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLP1P60201 277 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC7A9P82251 487 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABHD13Q7L211 337 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 STRADAQ7RTN6 431 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR2L3Q8NG85 312 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 PKIBQ9C010 78 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SERPINA3P01011 423 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SERPIND1P05546 499 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 CYB561P49447 251 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 RORCP51449 518 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 BST1Q10588 318 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 TGFBIQ15582 683 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPATA4Q8NEY3 305 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXO32Q969P5 355 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 P2RX4Q99571 388 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 NOX3Q9HBY0 568 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUP50Q9UKX7 468 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 WDR62O43379 1518 aa3.09□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 KMOO15229 486 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 CALM1P0DP23 149 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 CALM2P0DP24 149 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 CALM3P0DP25 149 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPX6P59796 221 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLAQ13239 276 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAJINQ3KP22 176 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR2L8Q8NGY9 312 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR4S2Q8NH73 311 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPR151Q8TDV0 419 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 H0YHG0 523 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 PALMO75781 387 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACTR3P61158 418 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 TCP10Q12799 353 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLINT1Q14677 625 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 PON3Q15166 354 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms