RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGHG4P01861 327 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACSM4P0C7M7 580 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACTN2P35609 894 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCZ1BP86790 482 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 AQP6Q13520 282 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZSWIM7Q19AV6 140 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM95Q3KNT9 176 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM52BQ4KMG9 183 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ORMDL2Q53FV1 153 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 MPV17L2Q567V2 206 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 BEND3Q5T5X7 828 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ATL3Q6DD88 541 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARL9Q6T311 187 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 C4orf50Q6ZRC1 276 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00173Q6ZV60 143 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC186Q7Z3E2 898 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR4C13Q8NGP0 309 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 HTR3CQ8WXA8 447 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 YIPF5Q969M3 257 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 AP2M1Q96CW1 435 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 OTUB2Q96DC9 234 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF75AQ96N20 296 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 OSBPL10Q9BXB5 764 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPZ1Q9BXG8 430 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPATA7Q9P0W8 599 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTRRQ9UBK8 725 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANGPT4Q9Y264 503 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ITIH6Q6UXX5 1313 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGF2RP11717 2491 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF462Q96JM2 2506 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 UBR4Q5T4S7 5183 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 URADA6NGE7 173 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 GGTLC3B5MD39 225 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 GGPS1O95749 300 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 GH1P01241 217 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGHV3-11P01762 117 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 LGALS2P05162 132 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ETS2P15036 469 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CYP2B6P20813 491 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD1CP29017 333 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 SSTR5P35346 364 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 LEPP41159 167 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF1P41567 113 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCR8P51685 355 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CASP9P55211 416 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 OSTNP61366 133 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPS21P63220 83 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCNA1P78396 465 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 PON2Q15165 354 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 PON3Q15166 354 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPRC6AQ5T6X5 926 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC39A4Q6P5W5 647 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPATA19Q7Z5L4 167 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 STK40Q8N2I9 435 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZADH2Q8N4Q0 377 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM184AQ8NB25 1140 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 ASB3Q9Y575 518 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 POLEQ07864 2286 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 CLUHO75153 1309 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 WASHC1A8K0Z3 465 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLIN3O60664 434 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 REM1O75628 298 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 STAMBPO95630 424 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 PAHP00439 452 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGHMP01871 453 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 FERP16591 822 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF708P17019 499 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR1G1P47890 313 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 TNFRSF17Q02223 184 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 BTN1A1Q13410 526 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 CASP8Q14790 479 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 RGNQ15493 299 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCL7AQ4VC05 210 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 KLHL12Q53G59 568 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 DEGS2Q6QHC5 323 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM179Q6ZVK1 233 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF546Q86UE3 836 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 PIFOQ8TCI5 191 aa-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms