RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC11A1P49279 550 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 UGT2B15P54855 530 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 GPNMBQ14956 572 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL40Q2TBA0 621 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5B3Q8NH48 314 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SGK3Q96BR1 496 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 FCRL1Q96LA6 429 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 MSH6P52701 1360 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CHD4Q14839 1912 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTA2P62736 377 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTG2P63267 376 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTC1P68032 377 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTA1P68133 377 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF92Q03936 586 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 NSDHLQ15738 373 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PNKDQ8N490 385 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf74Q96GX8 76 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 XCL2Q9UBD3 114 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CLN8Q9UBY8 286 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ING4Q9UNL4 249 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 TNRQ92752 1358 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ALDOBP05062 364 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CASC10Q5T4H9 136 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZR54 194 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 GPX8Q8TED1 209 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM54Q969K7 222 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP3A43Q9HB55 503 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRTO14522 1441 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMB11A5LHX3 300 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 MMP23AO75900 390 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CHTF8P0CG12 524 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ICAM2P13598 275 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 AQP2P41181 271 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 RORCP51449 518 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PRPS1P60891 318 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA0087Q14695 138 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 NRF1Q16656 503 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 XKR4Q5GH76 650 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF544Q6NX49 715 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM135Q86UB9 458 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM151AQ8WW52 585 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 DCUN1D4Q92564 292 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 UCN3Q969E3 161 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 MADDQ8WXG6 1647 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 FHAD1B1AJZ9 1412 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM231BA6NCW3 169 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF726A6NNF4 738 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms