RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	EDAR	Q9UNE0	448 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0B4J2A0	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MALL	Q13021	153 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	VWA2	Q5GFL6	755 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MANEA	Q5SRI9	462 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR10K2	Q6IF99	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF709	Q8N972	641 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM19	Q96E16	107 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RAB3C	Q96E17	227 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ATF6B	Q99941	703 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ETV7	Q9Y603	341 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TLCD2	A6NGC4	264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IFITM5	A6NNB3	132 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		A8MVM7	634 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CCS	O14618	274 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TNFSF12	O43508	249 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	FASLG	P48023	281 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN20	P56880	219 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R20	P59543	309 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GPR157	Q5UAW9	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PBX4	Q9BYU1	374 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SULT1B1	O43704	296 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RAD52	P43351	418 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EMD	P50402	254 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23	5e-8	■■■■■ 34.7
NEK1-208	ENST00000512193	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CORO6	Q6QEF8	472 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CMIP	Q8IY22	773 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PRR18	Q8N4B5	295 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	BCORP1	Q8N888	145 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR51B6	Q9H340	312 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	KLK11	Q9UBX7	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF175	Q9Y473	711 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM221	A6NGB7	291 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	AGAP14	A8MT82	685 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RAB6A	P20340	208 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	M6PR	P20645	277 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EPHA1	P21709	976 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN17	P56750	224 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR1D5	P58170	312 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CDK5	Q00535	292 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ACKR1	Q16570	336 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	FGF14	Q92915	247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TSLP	Q969D9	159 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	NICN1	Q9BSH3	213 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MED18	Q9BUE0	208 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR10A2	Q9H208	303 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0D9SG52	128 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LAMTOR5	O43504	91 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SCRG1	O75711	98 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EPX	P11678	715 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PTHLH	P12272	177 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DCTD	P32321	178 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT1	P36639	197 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CXCL12	P48061	93 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23

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