RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496372.1

CNIH3-212, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNIH3, Length 451 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-212ENST00000496372 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 FAM122BQ7Z309 247 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 WDR31Q8NA23 367 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 OR52N5Q8NH56 324 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 MCHR2Q969V1 340 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 RASD2Q96D21 266 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 C14orf79Q96F83 325 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 BOD1Q96IK1 185 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 RBP7Q96R05 134 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 KCNK17Q96T54 332 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 ALG12Q9BV10 488 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 IFT27Q9BW83 186 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 IL20Q9NYY1 176 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 CADP27708 2225 aa6.9□□□□□ -1.3
CNIH3-212ENST00000496372 ITPR2Q14571 2701 aa6.9□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 APCP25054 2843 aa6.9□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 PRSS37A4D1T9 235 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ERICH4A6NGS2 130 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 G3V2T6 193 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 H3BNX3 289 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 H7C1C5 153 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SOCS2O14508 198 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 IMPA2O14732 288 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SIAH2O43255 324 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 DHHO43323 396 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 IDH3BO43837 385 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CTAG2O75638 210 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SOX14O95416 240 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SLC2A10O95528 541 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TXNDC12O95881 172 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NR2C1P13056 603 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ANXA8P13928 327 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 B4GALT1P15291 398 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF23P17027 643 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF84P51523 738 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 LCN6P62502 163 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 FMODQ06828 376 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 COX10Q12887 443 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 MESTQ5EB52 335 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 THEM4Q5T1C6 240 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 C10orf128Q5T292 105 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SSX8Q7RTT4 187 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 FNDC8Q8TC99 324 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 PKP2Q99959 881 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NELFAQ9H3P2 528 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 S100A14Q9HCY8 104 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NGBQ9NPG2 151 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 FBN2P35556 2912 aa6.89□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 DSCAMO60469 2012 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms