RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 FRZBQ92765 325 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACOT7O00154 380 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF208O43345 1280 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRP3O75074 770 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 C8GP07360 202 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR15P49685 360 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 LMAN2Q12907 356 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMGN3Q15651 99 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF151Q2KHN1 245 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 MARC1Q5VT66 337 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 LCTLQ6UWM7 567 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 BIVMQ86UB2 503 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUSD6Q92537 303 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 GHSRQ92847 366 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXTL1Q92935 676 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGSF21Q96ID5 467 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SERTM1A2A2V5 107 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM238C9JI98 176 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 H7C417 338 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 J3QW42 95 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAMP1O60894 148 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARAFP10398 606 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB6AP20340 208 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 HTR1FP30939 366 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 BRS3P32247 399 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 NPY4RP50391 375 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAS2R20P59543 309 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERVFC1-1P60608 527 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELOBQ15370 118 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 MORN4Q8NDC4 146 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMCESQ96FZ2 354 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYT3Q9BQG1 590 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYT4Q9H2B2 425 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 MGAT4DA6NG13 374 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 MSGN1A6NI15 193 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 UMAD1C9J7I0 102 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF432O94892 652 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 AMBPP02760 352 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPN2P04844 631 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD82P27701 267 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFPI2P48307 235 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERVFRD-1P60508 538 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 GUCA2AQ02747 115 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5I1Q13606 314 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 NR0B2Q15466 257 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 C4orf17Q53FE4 359 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 MED27Q6P2C8 311 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 TERB2Q8NHR7 220 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA2D3-210ENST00000490478 FIBINQ8TAL6 211 aa6.28□□□□□ -1.4
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