RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 OR51A7Q8NH64 312 aa17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SLC7A13Q8TCU3 470 aa17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 MCHR2Q969V1 340 aa17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF75AQ96N20 296 aa17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 KCNS3Q9BQ31 491 aa17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 TMEM38BQ9NVV0 291 aa17.06■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 HTR3EA5X5Y0 456 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 EFCAB9A8MZ26 197 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SEMG1P04279 462 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 H1F0P07305 194 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 INHBBP09529 407 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 PATE4P0C8F1 98 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ACADSP16219 412 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 HGFACQ04756 655 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 GSG1Q2KHT4 349 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 PODNL1Q6PEZ8 512 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SLC22A24Q8N4F4 322 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 NSL1Q96IY1 281 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 COX4I2Q96KJ9 171 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 TXNIPQ9H3M7 391 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ANKRD19PQ9H560 264 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa17.05■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 A0A1W2PRQ8 180 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 NPIPB13A6NJU9 1138 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 B2RBV5 119 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 NPIPB4C9JG80 1138 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 RHCEP18577 417 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ACVR1BP36896 505 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 GIPRP48546 466 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 CTXN1P60606 82 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 FMODQ06828 376 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 DGCR6Q14129 220 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SEC23BQ15437 767 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 MST1LQ2TV78 715 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 FGD3Q5JSP0 725 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 VHLLQ6RSH7 139 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 OAFQ86UD1 273 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 CLDN22Q8N7P3 220 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 PYURFQ96I23 114 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 NSMCE2Q96MF7 247 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SH3GL3Q99963 347 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 CA10Q9NS85 328 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 NDE1Q9NXR1 346 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ADAM21Q9UKJ8 722 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ZFHX3Q15911 3703 aa17.04■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 CENPBD1B2RD01 187 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SLC2A10O95528 541 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 IGHMP01871 453 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 T-ENOLP0DO92 83 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 RAB1AP62820 205 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 TNK1Q13470 666 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 CLEC12BQ2HXU8 276 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 RINLQ6ZS11 566 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 HDDC2Q7Z4H3 204 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 OR4K5Q8NGD3 323 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 OR52J3Q8NH60 311 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 FBXO17Q96EF6 278 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 DHRS1Q96LJ7 313 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 TSPAN32Q96QS1 320 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 KCNK17Q96T54 332 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 BDH2Q9BUT1 245 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ZANQ9Y493 2812 aa17.03■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 C2CD3Q4AC94 2353 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 OR8G3PP0DMU2 310 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SLC9A3P48764 834 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 MNAT1P51948 309 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 RPL27P61353 136 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ADIPOQQ15848 244 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 SWI5Q1ZZU3 235 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 C10orf128Q5T292 105 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 RRM2BQ7LG56 351 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 OR4F15Q8NGB8 312 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF519Q8TB69 540 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 FUZQ9BT04 418 aa17.02■□□□□ 0.32
C1orf61-220ENST00000489918 UBL3O95164 117 aa17.01■□□□□ 0.31
C1orf61-220ENST00000489918 RAB36O95755 333 aa17.01■□□□□ 0.31
C1orf61-220ENST00000489918 OR4A8P0C604 315 aa17.01■□□□□ 0.31
C1orf61-220ENST00000489918 ATP6V1B2P21281 511 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms