RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ESCO2	Q56NI9	601 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	IFT81	Q8WYA0	676 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MARCH7	Q9H992	704 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TBK1	Q9UHD2	729 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NPHS1	O60500	1241 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	HPR	P00739	348 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PTH	P01270	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	C1QC	P02747	245 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MYZAP	P0CAP1	466 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NR2F1	P10589	423 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	PAX2	Q02962	417 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	EMX2	Q04743	252 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MRAP	Q8TCY5	172 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF726	A6NNF4	738 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CD55	P08174	381 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CSF1	P09603	554 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LIPA	P38571	399 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LOXL3	P58215	753 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	BPIFB3	P59826	476 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CASP8	Q14790	479 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	AGR3	Q8TD06	166 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	DYRK2	Q92630	601 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	C12orf10	Q9HB07	376 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A087WUJ7	227 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	RIPK2	O43353	540 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TGDS	O95455	350 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CPT2	P23786	658 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	CSNK1A1	P48729	337 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	BTG1	P62324	171 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MAPK11	Q15759	364 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SPRN	Q5BIV9	151 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	MIER2	Q8N344	545 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TESC	Q96BS2	214 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF121	Q9H920	327 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	NANOG	Q9H9S0	305 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SHOC2-205	ENST00000489390	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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