RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488734.5

GIGYF2-241, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 3

Gene GIGYF2, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-241	ENST00000488734	TWIST1	Q15672	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	UTF1	Q5T230	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734		Q6ZS52	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	TTL	Q8NG68	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ART4	Q93070	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CSF3R	Q99062	836 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	C1orf198	Q9H425	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	PTPRB	P23467	1997 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SIRPB1	O00241	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	IGHG4	P01861	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	HLA-H	P01893	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	IFNW1	P05000	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	MYOD1	P15172	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SYT1	P21579	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	LMO1	P25800	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	AQP2	P41181	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CSK	P41240	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CDKN2C	P42773	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	AMT	P48728	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CCR8	P51685	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CDR2	Q01850	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ZNF234	Q14588	700 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	TRAM2	Q15035	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	TNXA	Q16473	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CYS1	Q717R9	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GIGYF2-241	ENST00000488734	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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