RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 RAP1AP62834 184 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TNK1Q13470 666 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ACKR1Q16570 336 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 NTRK2Q16620 822 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GHDCQ8N2G8 530 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SAP25Q8TEE9 199 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SPTBP11277 2137 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GPR171O14626 319 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GRPRP30550 384 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 CMTM4Q8IZR5 234 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 MCHR2Q969V1 340 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 C4orf45Q96LM5 186 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ING3Q9NXR8 418 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GABARAPH6UMI1 98 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ARHGEF9O43307 516 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 DHFRP00374 187 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 HEXBP07686 556 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 CRABP1P29762 137 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 PTGS2P35354 604 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 HOXD12P35452 270 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 MADCAM1Q13477 382 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 PMS2CLQ68D20 193 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM205Q6UW68 189 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 OR5L2Q8NGL0 311 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GPR148Q8TDV2 347 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 RNF128Q8TEB7 428 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 HSD17B8Q92506 261 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ACTR6Q9GZN1 396 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 PISDQ9UG56 409 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SLC22A23A1A5C7 686 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ACOD1A6NK06 481 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SCO2O43819 266 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 NUDT14O95848 222 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 CD37P11049 281 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SLC17A1Q14916 467 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 PCK2Q16822 640 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 C1QL3Q5VWW1 255 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF679Q8IYX0 411 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 C8orf44Q96CB5 159 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 POTEKPQ9BYX7 375 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PPK0 400 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM200CA6NKL6 621 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GFRA3O60609 400 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SERPINI2O75830 405 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.655e-14■■■■□ 25.2
PTPRF-212ENST00000477970 ELFN2Q5R3F8 820 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SLC18B1Q6NT16 456 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 DUSP19Q8WTR2 217 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 MIB2Q96AX9 1013 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 HAVCR1Q96D42 359 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 OR2M2Q96R28 347 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 RARRES3Q9UL19 164 aa11□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TVP23AA6NH52 213 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 H7C1C5 153 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GSTT2P0CG29 244 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GSTT2BP0CG30 244 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 GZMKP49863 264 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 LCN6P62502 163 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 DGCR2P98153 550 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TOMM20Q15388 145 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM53Q6P2H8 277 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 ASB18Q6ZVZ8 466 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 DPY19L4Q7Z388 723 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 SYT9Q86SS6 491 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRF-212ENST00000477970 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms