RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 MAKP20794 623 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 CDAP32320 146 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 IDH3AP50213 366 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TMEM33P57088 247 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 RBBP4Q09028 425 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 DUSP7Q16829 419 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 USP51Q70EK9 711 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 PXKQ7Z7A4 578 aa9.55□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 PTOV1Q86YD1 416 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 LRRC18Q8N456 261 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SYT14Q8NB59 555 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR5J2Q8NH18 312 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SPDL1Q96EA4 605 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 DUX5Q96PT3 197 aa9.55□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.55□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 CDH20Q9HBT6 801 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.55□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.55□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TMEM89A2RUT3 159 aa9.54□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 MFN2O95140 757 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR6A2O95222 327 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 QDPRP09417 244 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 PCMT1P22061 227 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 CCNOP22674 350 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC6A2P23975 617 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 MPV17P39210 176 aa9.54□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 LCN2P80188 198 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF74Q16587 644 aa9.54□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ACSM5Q6NUN0 579 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.54□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR6S1Q8NH40 331 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OR6X1Q8NH79 312 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.54□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.54□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 ZNF416Q9BWM5 594 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 OPN4Q9UHM6 478 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 VWFP04275 2813 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 NOTCH1P46531 2555 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 A0A0A6YYJ9 748 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.53□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 SLC2A10O95528 541 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 IGHV2-5P01817 119 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 F13BP05160 661 aa9.53□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 PGA3P0DJD8 388 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF250P15622 560 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TNFRSF1BP20333 461 aa9.53□□□□□ -0.88
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ACTB-209ENST00000473257 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 FAM216AQ8WUB2 273 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF566Q969W8 418 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF607Q96SK3 696 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-209ENST00000473257 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ISPDA4D126 451 aa9.52□□□□□ -0.89
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