RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQ09 198 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM30A4D0T7 59 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CASKO14936 926 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HPGDSO60760 199 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM127O75204 238 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZFPL1O95159 310 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 WNT11O96014 354 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 EPXP11678 715 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ADRA2CP18825 462 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 ELK1P19419 428 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 NPR2P20594 1047 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 H3F3AP84243 136 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 P2RY14Q15391 338 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 HIST3H3Q16695 136 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 LIPNQ5VXI9 398 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TXNDC15Q96J42 360 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf45Q96LM5 186 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL15Q96M94 604 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 DERL3Q96Q80 235 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR8B4Q96RC9 309 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 INTS14Q96SY0 518 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 CHST11Q9NPF2 352 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 TVP23AA6NH52 213 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 A6NIZ1 184 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TTLL8A6PVC2 850 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 NOTOA8MTQ0 251 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF879B4DU55 563 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf172C9J069 976 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 C9J4A7 227 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PHYHO14832 338 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GMFGO60234 142 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZIC3O60481 467 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SLC19A2O60779 497 aa5.05□□□□□ -1.6
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