RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF525Q8N782 197 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF148Q8N7C7 305 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL17RDQ8NFM7 739 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FGFBP3Q8TAT2 258 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MCHR2Q969V1 340 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEPHS2Q99611 448 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADA2Q9NZK5 511 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HIF3AQ9Y2N7 669 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 B9A039 149 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR8G3PP0DMU2 310 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SAGP10523 405 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACADSP16219 412 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAKP20794 623 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFNA4P52798 201 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKCDQ05655 676 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAG1Q14118 895 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFNB3Q15768 340 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALG10Q5BKT4 473 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARMC4Q5T2S8 1044 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GLYATQ6IB77 296 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT80Q6KB66 452 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SH3GL3Q99963 347 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS6KA6Q9UK32 745 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENPP4Q9Y6X5 453 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CR1P17927 2039 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAV27A0A087WT01 109 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A087WUU8 490 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPBD1B2RD01 187 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENTPD5O75356 428 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LY6HO94772 140 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPR2P20594 1047 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF84P51523 738 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB39AQ14964 217 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF730Q6ZMV8 503 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIGWQ7Z7B1 504 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGFN1Q86VF2 1251 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM156AQ8NDB6 213 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR4K5Q8NGD3 323 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC37BQ96QE4 947 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TXNIPQ9H3M7 391 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLK3Q9H4B4 646 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CSPG4Q6UVK1 2322 aa13.46□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFCAB9A8MZ26 197 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 hCG_2039718K7EN88 272 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GMNNO75496 209 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FARS2O95363 451 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC2A10O95528 541 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF35P13682 527 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NR4A1P22736 598 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR4P46093 362 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DSCR9P59020 149 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FHL1Q13642 323 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NRN1LQ496H8 165 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C10orf128Q5T292 105 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBPL2Q6SJ96 375 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OAFQ86UD1 273 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF584Q8IVC4 421 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC75AQ8NAA5 344 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR13C2Q8NGS9 318 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR51A7Q8NH64 312 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNK17Q96T54 332 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD19PQ9H560 264 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAGLN3Q9UI15 199 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXL3Q9UKT7 428 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FKBP7Q9Y680 259 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms