RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452271.6

SBSN-201, Transcript of suprabasin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBSN, Length 1,945 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSN-201ENST00000452271 SSX6Q7RTT6 188 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 EFNA2O43921 213 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 NEURL1O76050 574 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 PYCR1P32322 319 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 THBS2P35442 1172 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 SLC3A1Q07837 685 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 IL18Q14116 193 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 CDONQ4KMG0 1287 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 OR5J2Q8NH18 312 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 STK35Q8TDR2 534 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 DEPPQ9NTK1 212 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 MEIOCA2RUB1 952 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 SERPINA3P01011 423 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 BGLAPP02818 100 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 ELK1P19419 428 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 MYL9P24844 172 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 DPP4P27487 766 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 AQP2P41181 271 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 IDNKQ5T6J7 187 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 TRIQKQ629K1 86 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 TRILQ7L0X0 811 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 GHSRQ92847 366 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 ITFG2Q969R8 447 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 ARL5BQ96KC2 179 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 KCNJ15Q99712 375 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 FKRPQ9H9S5 495 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSN-201ENST00000452271 H3BML4 177 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 CBR3O75828 277 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 AHSA1O95433 338 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 OPN1LWP04000 364 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 HIST1H2ABP04908 130 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 OR1C1Q15619 314 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 RPTNQ6XPR3 784 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 SLC39A7Q92504 469 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 SMIM19Q96E16 107 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 PELI1Q96FA3 418 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 MFRPQ9BY79 579 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 A0A0G2JK05 382 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 OR6C68A6NDL8 312 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 ZNF208O43345 1280 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 TFPIP10646 304 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 SPI1P17947 270 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 CNR1P21554 472 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 ACVR1BP36896 505 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 KIR2DL3P43628 341 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 CCL11P51671 97 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 SOX8P57073 446 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 SIRPAP78324 504 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 HSF2Q03933 536 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 CDK5R1Q15078 307 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 CCDC58Q4VC31 144 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 NMNAT3Q96T66 252 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 HES7Q9BYE0 225 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 MMP28Q9H239 520 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSN-201ENST00000452271 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms