RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SPERTQ8NA61 448 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 OR2T12Q8NG77 320 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 OR2T11Q8NH01 316 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CNIH3Q8TBE1 160 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 STAG3L4Q8TBR4 150 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 DOK4Q8TEW6 326 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF721Q8TF20 911 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC9A6Q92581 669 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 HTRA1Q92743 480 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TMCO6Q96DC7 493 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 EGLN2Q96KS0 407 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF382Q96SR6 550 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CCL19Q99731 98 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 DUSP26Q9BV47 211 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 GON7Q9BXV9 100 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 OR8D2Q9GZM6 311 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CCDC90BQ9GZT6 254 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 KLK15Q9H2R5 256 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PROK2Q9HC23 129 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 POLE4Q9NR33 117 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PCTPQ9UKL6 214 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CADP27708 2225 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.94□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 C17orf105B2RV13 164 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 C9JVG2 144 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 RTCAO00442 366 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PPP6CO00743 305 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 GNGT2O14610 69 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 AIREO43918 545 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 WDR1O75083 606 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SH3BGRLO75368 114 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SEMA3DO95025 777 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CRYZL1O95825 349 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 FSHBP01225 129 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 P04436 131 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 YES1P07947 543 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CSF1P09603 554 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 LYL1P12980 280 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PAX1P15863 534 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TSPAN8P19075 237 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CD22P20273 847 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 BMP5P22003 454 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 IGFBP5P24593 272 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 PSMB9P28065 219 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 RRM2P31350 389 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 FMO3P31513 532 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC6A12P48065 614 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ASCL1P50553 236 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 OR2B6P58173 313 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 EFR3AQ14156 821 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 IRF3Q14653 427 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC10A1Q14973 349 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TSNQ15631 228 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ZFP69Q49AA0 526 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CCDC58Q4VC31 144 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 LIPNQ5VXI9 398 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TIGD3Q6B0B8 471 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 FAHD1Q6P587 224 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 Q6ZSR9 355 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 CYP4Z1Q86W10 505 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 MSRB3Q8IXL7 192 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF595Q8IYB9 648 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 LIX1Q8N485 282 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM86B1Q8N7N1 296 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 MORN4Q8NDC4 146 aa4.93□□□□□ -1.62
NANOGP4-201ENST00000427230 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms