RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM106AQ96A25 262 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF524Q96C55 264 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 LPAR4Q99677 370 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHDC3Q9BQ90 382 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 MRI1Q9BV20 369 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR76Q9H967 626 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP25Q9NPA2 562 aa16.94■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 LRRN1Q6UXK5 716 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF227Q86WZ6 799 aa16.92■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 SYT4Q9H2B2 425 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK15Q9H427 330 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNA1EQ15878 2313 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2M5A3KFT3 312 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.91■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 OR4C16Q8NGL9 310 aa16.91■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM127O75204 238 aa16.91■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 GUCA2AQ02747 115 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 SKP2Q13309 424 aa16.91■□□□□ 0.3
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS35Q8N3Z0 413 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5M1Q8NGP8 315 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 AMELYQ99218 206 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRPGP15A8MWD9 76 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD1O60671 282 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 C4BPBP20851 252 aa16.91■□□□□ 0.3
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