RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC23BQ15437 767 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBED5Q49AG3 693 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 AGAP6Q5VW22 663 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS57Q6UWY2 283 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 IGFN1Q86VF2 1251 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNS3Q9BQ31 491 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 KATNB1Q9BVA0 655 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 PTP4A3O75365 173 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE5AO76074 875 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 GADD45GO95257 159 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CELA3BP08861 270 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 OMPP47874 163 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 DTX2Q86UW9 622 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 DHFR2Q86XF0 187 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SKA3Q8IX90 412 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXL14Q8N1E6 418 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC22A24Q8N4F4 322 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NOXO1Q8NFA2 376 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4K5Q8NGD3 323 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 FUZQ9BT04 418 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIP2Q9C0E4 1043 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC61A2Q9H9S3 476 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHMP01871 453 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8G3PP0DMU2 310 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V1B2P21281 511 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ACVR1BP36896 505 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5J2P56134 94 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB1AP62820 205 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SPIBQ01892 262 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NPRL3Q12980 569 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 GSG1Q2KHT4 349 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 Q5PR19 223 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF544Q6NX49 715 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MUC15Q8N387 334 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 THTPAQ9BU02 230 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MUC13Q9H3R2 512 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF224Q9NZL3 707 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 AURKCQ9UQB9 309 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 HIVEP1P15822 2718 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ENTPD5O75356 428 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 UBOX5O94941 541 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 PATE4P0C8F1 98 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CALCRP30988 508 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL4P36578 427 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CDKN1AP38936 164 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 LIMS1P48059 325 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF84P51523 738 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK-25P63136 954 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MTX3Q5HYI7 312 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FGFBP3Q8TAT2 258 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CLPTM1LQ96KA5 538 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPAN32Q96QS1 320 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RBP7Q96R05 134 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNK17Q96T54 332 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3GL3Q99963 347 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NOX3Q9HBY0 568 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CBLN4Q9NTU7 201 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DSCAMO60469 2012 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TCRBV5S2A0A599 114 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 UBL3O95164 117 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FARS2O95363 451 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RRM2P31350 389 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GIPRP48546 466 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CD47Q08722 323 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 THEM4Q5T1C6 240 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 C10orf128Q5T292 105 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 LCN8Q6JVE9 175 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZER1Q7Z7L7 766 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4F15Q8NGB8 312 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF75AQ96N20 296 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GPA33Q99795 319 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ALG12Q9BV10 488 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GRHPRQ9UBQ7 328 aa18.32■□□□□ 0.52
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