RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 STK11Q15831 433 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-272P-201ENST00000411028 PRELID2Q8N945 189 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-272P-201ENST00000411028 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAB1CQ92928 201 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-272P-201ENST00000411028 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-272P-201ENST00000411028 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-272P-201ENST00000411028 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 THSD7BQ9C0I4 1608 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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RNU6-272P-201ENST00000411028 TAS2R19P59542 299 aa3.21□□□□□ -1.9
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RNU6-272P-201ENST00000411028 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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RNU6-272P-201ENST00000411028 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.21□□□□□ -1.9
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RNU6-272P-201ENST00000411028 OR5T3Q8NGG3 340 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR56A4Q8NGH8 313 aa3.21□□□□□ -1.9
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RNU6-272P-201ENST00000411028 C7orf33Q8WU49 177 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM54Q969K7 222 aa3.21□□□□□ -1.9
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RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM94Q12767 1356 aa3.21□□□□□ -1.9
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RNU6-272P-201ENST00000411028 ZBTB5O15062 677 aa3.2□□□□□ -1.9
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RNU6-272P-201ENST00000411028 HPNP05981 417 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLTAP09496 248 aa3.2□□□□□ -1.9
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RNU6-272P-201ENST00000411028 MGMTP16455 207 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCNG1P51959 295 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 HADHBP55084 474 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACTA2P62736 377 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACTG2P63267 376 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACTC1P68032 377 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACTA1P68133 377 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARFRP1Q13795 201 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPNMBQ14956 572 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 STK38Q15208 465 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 MLIPQ5VWP3 458 aa3.2□□□□□ -1.9
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