RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 NRMQ8IXM6 262 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 NUP37Q8NFH4 326 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 PFN4Q8NHR9 129 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ASB10Q8WXI3 467 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 PYURFQ96I23 114 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 Q96MF0 132 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 MUC13Q9H3R2 512 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 CD300AQ9UGN4 299 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 MOKQ9UQ07 419 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.4□□□□□ -1.22
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A087WUU8 490 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 FFAR1O14842 300 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 PRSS23O95084 383 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHMP01871 453 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 F13BP05160 661 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CSF3P09919 207 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CD79AP11912 226 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NCK1P16333 377 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 IFNGR2P38484 337 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB1AP62820 205 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 PLP2Q04941 152 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LAPTM4AQ15012 233 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 EFNB3Q15768 340 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBED5Q49AG3 693 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 C10orf128Q5T292 105 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MDP1Q86V88 176 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MCHR2Q969V1 340 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 C7orf34Q96L11 122 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF347Q96SE7 839 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 WACQ9BTA9 647 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SIAEQ9HAT2 523 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CA10Q9NS85 328 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 B2RBV5 119 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 H7C1Q1 480 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 XKRYO14609 159 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 KRT36O76013 467 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 HLA-HP01893 362 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINA5P05154 406 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CD14P08571 375 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 B4GALT1P15291 398 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CALB2P22676 271 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NR4A1P22736 598 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CDKN1AP38936 164 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 GIPRP48546 466 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 EVX1P49640 407 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 EFNA4P52798 201 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 CTXN1P60606 82 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 PCBD1P61457 104 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TUBA1BP68363 451 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TUBA4AP68366 448 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 GALK2Q01415 458 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SPOCK1Q08629 439 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 NPRL3Q12980 569 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 DAG1Q14118 895 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 MELKQ14680 651 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 TUBA1AQ71U36 451 aa7.38□□□□□ -1.23
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.38□□□□□ -1.23
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