RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.51■□□□□ 0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC22O60826 627 aa15.5■□□□□ 0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 MAKP20794 623 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 GIFP27352 417 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 NR4A2P43354 598 aa15.48■□□□□ 0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 SPATA21Q7Z572 469 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 TPD52L3Q96J77 140 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SH3GL3Q99963 347 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SMURF2Q9HAU4 748 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15.48■□□□□ 0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 USF1P22415 310 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 PRKCDQ05655 676 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 LAPTM4AQ15012 233 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 IQCCQ4KMZ1 466 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.47■□□□□ 0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 MDFIQ99750 246 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM160Q9NX00 188 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A087WUU8 490 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PRG6 482 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNX3O60493 162 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNAP29O95721 258 aa15.46■□□□□ 0.07
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