RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365367.1

RNU6-53P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 53, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-53P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-53P-201ENST00000365367 KCNJ1P48048 391 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SOX2P48431 317 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 BMXP51813 675 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRPS1P60891 318 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 RPL15P61313 204 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GNB2P62879 340 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GALK2Q01415 458 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 C17orf67Q0P5P2 114 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 NPRL3Q12980 569 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SCGB2A2Q13296 93 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 EFR3AQ14156 821 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TFDP2Q14188 446 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRPSAP1Q14558 356 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC17A1Q14916 467 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PDK3Q15120 406 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 QPRTQ15274 297 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TGFBIQ15582 683 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAPK14Q16539 360 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 DUSP5Q16690 384 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 AP5B1Q2VPB7 878 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 C4orf46Q504U0 113 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF585BQ52M93 769 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SPATA46Q5T0L3 261 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LCE3CQ5T5A8 94 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LRRC38Q5VT99 294 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM205BPQ63HN1 556 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR52E8Q6IFG1 317 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR7E24Q6IFN5 339 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 NIPAL1Q6NVV3 410 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 KLHL24Q6TFL4 600 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 UGT2A3Q6UWM9 527 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM107Q6UX40 140 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CASP12Q6UXS9 341 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 WDR88Q6ZMY6 472 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 RNF165Q6ZSG1 346 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMPPEQ6ZT21 453 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 VMO1Q7Z5L0 202 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GALNT5Q7Z7M9 940 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM219Q86XT9 240 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 KLBQ86Z14 1044 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 VSTM4Q8IW00 320 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SKA3Q8IX90 412 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF100Q8IYN0 542 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 C10orf111Q8N326 155 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MIER2Q8N344 545 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 C17orf78Q8N4C9 275 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF283Q8N7M2 679 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SCAIQ8N9R8 606 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 L3MBTL4Q8NA19 623 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MLKLQ8NB16 471 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR4K14Q8NGD5 310 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF675Q8TD23 568 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAIP1Q8WWC4 291 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 C1orf54Q8WWF1 131 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SSMEM1Q8WWF3 244 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LRTOMTQ8WZ04 291 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 PEX13Q92968 403 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MYDGFQ969H8 173 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SEH1LQ96EE3 360 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 WDFY2Q96P53 400 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MOGAT1Q96PD6 335 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR5B2Q96R09 309 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ARHGDIGQ99819 225 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC30A2Q9BRI3 323 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM246Q9BRR3 403 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CCDC106Q9BWC9 280 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF416Q9BWM5 594 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CHID1Q9BWS9 393 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TSSK1BQ9BXA7 367 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 OSBPL8Q9BZF1 889 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 LAT2Q9GZY6 243 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF385DQ9H6B1 395 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CAB39LQ9H9S4 337 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF556Q9HAH1 456 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CRLF2Q9HC73 371 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 SIRT7Q9NRC8 400 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 CTPS2Q9NRF8 586 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM106BQ9NUM4 274 aa0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms