RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359366.9

ATXN3-202, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 2,584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-202ENST00000359366 LINC01387J3KSC0 135 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 NDUFS8O00217 210 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 DCTN6O00399 190 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ABCD4O14678 606 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 FLRT2O43155 660 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SELENOFO60613 162 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ITGA10O75578 1167 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 NDUFB2O95178 105 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 IFNA4P05014 189 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 JMJD7P0C870 316 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SMIM6P0DI80 62 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 PIPP12273 146 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 GP1BBP13224 206 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 HLA-DOBP13765 273 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 HTR1FP30939 366 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 RBM34P42696 430 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 PNLIPRP2P54317 469 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 CTXN1P60606 82 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 DCAF7P61962 342 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 TEKQ02763 1124 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ZNF181Q2M3W8 571 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 MEDAGQ5VYS4 303 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 NXNL2Q5VZ03 156 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 C22orf42Q6IC83 251 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 TMEM205Q6UW68 189 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 RTL4Q6ZR62 310 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 WDFY1Q8IWB7 410 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 PHC2Q8IXK0 858 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 Q8N3U1 123 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ZNF511Q8NB15 262 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OR11G2Q8NGC1 345 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OR5W2Q8NH69 310 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 CT55Q8WUE5 264 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 FCGR1BQ92637 280 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 TEAD3Q99594 435 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 MND1Q9BWT6 205 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 TEX12Q9BXU0 123 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 MMP25Q9NPA2 562 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ERVK13-1Q9NX77 482 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 NCDNQ9UBB6 729 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 CHRNA9Q9UGM1 479 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ZNF337Q9Y3M9 751 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 NCKAP5O14513 1909 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 TVP23AA6NH52 213 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OR6C70A6NIJ9 312 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 CD8B2A6NJW9 211 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OR6C76A6NM76 312 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 C9orf172C9J069 976 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 EFNA2O43921 213 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ZFAND5O76080 213 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OPN1MWP04001 364 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SCG5P05408 212 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 TSPAN19P0C672 248 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 CD8BP10966 210 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 COX6A1P12074 109 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 HK1P19367 917 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 CELP19835 753 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 KLK2P20151 261 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 PAICSP22234 425 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SLC6A6P31641 620 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 OR12D2P58182 307 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 RAB40BQ12829 278 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 FOXF1Q12946 379 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 MELKQ14680 651 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 ISXQ2M1V0 245 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 TP53I3Q53FA7 332 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 LEG1Q6P5S2 330 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 LYPD8Q6UX82 237 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 LUZP2Q86TE4 346 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 HGDQ93099 445 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 FBXW5Q969U6 566 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 CRELD1Q96HD1 420 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-202ENST00000359366 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms