RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LCN8Q6JVE9 175 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GAREM2Q75VX8 874 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 RNF170Q96K19 258 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GPR137BO60478 399 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF623O75123 536 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 AOAHP28039 575 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 S100A7P31151 101 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MMP12P39900 470 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MKS1Q9NXB0 559 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 NPTNQ9Y639 398 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GPR37O15354 613 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 KCNK2O95069 426 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ITGAMP11215 1152 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SUOXP51687 545 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 RAB38P57729 211 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DUSP7Q16829 419 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ABHD6Q9BV23 337 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.75□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TSTD3H0UI37 97 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OR5G3P0C626 314 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OR5I1Q13606 314 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LILRA2Q8N149 483 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 HTN1P15515 57 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CCR6P51684 374 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 FNDC8Q8TC99 324 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PDXPQ96GD0 296 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 KCND3Q9UK17 655 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ABCD4O14678 606 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DPF1Q92782 380 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TSSK2Q96PF2 358 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 IL37Q9NZH6 218 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 TMEM82A0PJX8 343 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SERINC4A6NH21 518 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SCO1O75880 301 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PDGFAP04085 211 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GABARAPL2P60520 117 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CPZQ66K79 652 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF626Q68DY1 528 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PRR27Q6MZM9 219 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LAX1Q8IWV1 398 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZNF511Q8NB15 262 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ZFP57Q9NU63 452 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DCAF16Q9NXF7 216 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 LHX3Q9UBR4 397 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 NAGKQ9UJ70 344 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.74□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 DNAJC13O75165 2243 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SLC22A23A1A5C7 686 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 FUOMA2VDF0 154 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 SSSCA1O60232 199 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 GFRALQ6UXV0 394 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 NOXA1Q86UR1 476 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OR10G3Q8NGC4 313 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 OR56B4Q8NH76 319 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ELP4Q96EB1 424 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 IL17CQ9P0M4 197 aa9.73□□□□□ -0.85
CLN8-201ENST00000331222 ASB4Q9Y574 426 aa9.73□□□□□ -0.85
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