RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 C1orf198Q9H425 327 aa5.9□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.9□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 OR5K4A6NMS3 321 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TAAR5O14804 337 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZFPL1O95159 310 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 LYPD3O95274 346 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GP1BAP07359 652 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 POU3F4P49335 361 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CTXN1P60606 82 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 B2MP61769 119 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CST6Q15828 149 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MTFR2Q6P444 385 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 VITQ6UXI7 678 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF627Q7L945 461 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 AVL9Q8NBF6 648 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TMEM106AQ96A25 262 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TIMP4Q99727 224 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TREM1Q9NP99 234 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CA10Q9NS85 328 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZFP57Q9NU63 452 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SERINC4A6NH21 518 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF98A6NK75 572 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 POM121CA8CG34 1229 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RFXAPO00287 272 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CTAG2O75638 210 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SLC25A12O75746 678 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 WNT11O96014 354 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MAS1P04201 325 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ITGB2P05107 769 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 THEGLP0DJG4 465 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 HLA-GP17693 338 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RAB6AP20340 208 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GSK3AP49840 483 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FDX2Q6P4F2 183 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GPX8Q8TED1 209 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MYLIPQ8WY64 445 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 A0A0C4DFX4 3053 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 A0A1B0GVT2 93 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TMEM218A2RU14 115 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SPINT1O43278 529 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TNFSF14O43557 240 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SELENOFO60613 162 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TXNDC12O95881 172 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 HLA-DQA2P01906 255 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RNH1P13489 461 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ADH6P28332 368 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 HTR2CP28335 458 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PBX2P40425 430 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PCP4P48539 62 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FNTBP49356 437 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RAB13P51153 203 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FXYD6P3P58550 94 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 KLHL26Q53HC5 615 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SSX6Q7RTT6 188 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 LYG2Q86SG7 212 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GALNT16Q8N428 558 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SLC39A7Q92504 469 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 DGAT2Q96PD7 388 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NMNAT3Q96T66 252 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SYT4Q9H2B2 425 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 POFUT1Q9H488 388 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RAB22AQ9UL26 194 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms